Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF738-202ENST00000380870 1142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LRRC72-202ENST00000401542 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC01105-202ENST00000431182 708 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC245517.1-201ENST00000444224 1262 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL592103.1-201ENST00000446321 810 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC080013.1-205ENST00000477589 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SAP30L-AS1-203ENST00000522312 569 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AP000915.1-201ENST00000580756 548 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC02201-202ENST00000511194 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 TMEM207-201ENST00000354905 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C4orf48Q5BLP8 CSF2RA-202ENST00000355805 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms