Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHQ16836 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHQ16836 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHQ16836 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms