Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms