Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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