Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF1AQ16665 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF1AQ16665 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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