Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FXNQ16595 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FXNQ16595 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FXNQ16595 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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