Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
USF2Q15853 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF2Q15853 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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