Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms