Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms