Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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