Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms