Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms