Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms