Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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NCAPHQ15003 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NCAPHQ15003 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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