Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms