Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms