Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms