Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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