Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIDRQ14159 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms