Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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