Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms