Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms