Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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