Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms