Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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