Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms