Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms