Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms