Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4BQ07343 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4BQ07343 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4BQ07343 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4BQ07343 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4BQ07343 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4BQ07343 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms