Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TYRO3Q06418 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms