Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms