Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms