Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms