Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP46P62068 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP46P62068 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP46P62068 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP46P62068 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP46P62068 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP46P62068 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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