Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms