Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms