Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms