Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI2P48788 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms