Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A1P43005 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms