Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms