Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms