Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms