Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms