Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms