Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms