Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms