Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms