Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms