Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms