Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms